이전 포스팅 2020/06/23 - [생물정보학] - NGS 기반 DNA data 기본 분석 NGS 기반 DNA data 기본 분석 이전 포스팅 2020/06/18 - [생물정보학] - 생물정보학(Bioinformatics) 회사에서 생물정보학자는 무슨일을 하는지, 현재 제가 하는일은 무엇인지 간단히 알아보았습니다. 이번엔, DNA 데이터가 도착하면 bio-info.tistory.com 에서 NGS 시퀀싱 결과 DNA 기본 분석 알고리즘에 대해 알아보았습니다. 이번 포스팅에선 타겟 선별(Target enrishment)과 타겟의 범위에 따른 DNA 시퀀싱 종류 3가지를 알아보겠습니다. Contents 1. 타켓 선별(Target enrishment) 타켓 선별은 앰플리콘 방식과 캡쳐 방식으로 나뉩니다. ..
1. MultiQC란? MultiQC는 bioinformatics 기본 분석 과정에 생성되는 log파일들을 자동으로 인식하고, 취합하여 보기 좋게 HTML 리포트를 생성해주는 툴입니다. 즉, bioinformatics의 여러 가지 툴들의 Output을 log파일로써 인식하여, 시각화를 해줍니다. MultiQC modules에서 어떤 툴들의 Output을 사용할 수 있는지 형태가 자세히 나옵니다. 기본적인 사용방법은 MultiQC document에 나와있으며, MultiQC github도 제공해 줍니다. 2. 설치 방법 conda를 이용한 설치방법과 pip를 이용한 설치방법이 있습니다. 1) conda 이용 a. multiqc 다운로드 conda install -c bioconda multiqc b. 만약..
