-목차- 1. 배경 2. My module 리포트에 추가 3. 설치 4. 과정 5. 실행 [Tools] - MultiQC에서 Multiqc 툴에 대해 간단히 알아보았습니다. 이번엔 MultiQC에서 Custom Contents를 직접 코드로 짜고 데이터를 추가하는 방법을 알아보겠습니다. 1. 배경 MultiQC를 이용해 QC 리포트를 생성합니다. Custom Contents 이용을 위해 MultiQC는 개발자 모드로 사용합니다.(MultiQC v1.10.dev0) MulitQC에 없는 툴에 대한 로그파일은 직접 코드를 작성하여 그래프를 작성합니다. 2. My module 리포트에 추가 아래처럼 Multiqc리포트에 나만의 데이터를 시각화할 수 있습니다. 3. 설치 1) MultiQC의 깃헙 사이트(htt..
1. MultiQC란? MultiQC는 bioinformatics 기본 분석 과정에 생성되는 log파일들을 자동으로 인식하고, 취합하여 보기 좋게 HTML 리포트를 생성해주는 툴입니다. 즉, bioinformatics의 여러 가지 툴들의 Output을 log파일로써 인식하여, 시각화를 해줍니다. MultiQC modules에서 어떤 툴들의 Output을 사용할 수 있는지 형태가 자세히 나옵니다. 기본적인 사용방법은 MultiQC document에 나와있으며, MultiQC github도 제공해 줍니다. 2. 설치 방법 conda를 이용한 설치방법과 pip를 이용한 설치방법이 있습니다. 1) conda 이용 a. multiqc 다운로드 conda install -c bioconda multiqc b. 만약..
